Manuellt exempel på beta-oxidation av fettsyror

Förberedelse

Bygg oktansyra, använd en mjuk dubbelbindning som bindning mellan varannan kolatom (dvs. ej mellan de två första).

Gör också två vattenmolekyler.

Gör fyra H-SCoA genom att låta en liten grön representera -SCoA.

1. Bind ihop -SCoA med syran genom att ta bort en vattenmolekyl (den + de två vattenmolekylerna behövs senare).

(Nu börjar cirklandet)

2.   Ta bort ett väte vardera från de två kolatomerna närmast kolet som är i karboxylgruppen. Sätt ihop vätena (ska egentligen vara FADH₂) och lägg i en FAD-hög. Byt ut bindningen som är kvar mot en mjuk dubbelbindning och förena kolatomerna med denna.

3.   Ta vattenmolekylen och ta bort ett väte med sin bindning. Bryt upp dubbelbindningen mellan kolatomerna så att själva bindningen sitter kvar i den tredje kolatomen. Sätt OH-gruppen på den uppbrutna dubbel­bindningen och sätt vätet med sin bindning på den tomma platsen i kolatom två.

4.   Ta bort vätet från OH-gruppen och vätet på kolatomen som sitter vid OH-gruppen. Sätt ihop vätena (ska egentligen vara NADH + H⁺) och lägg i en NAD-hög. Byt ut bindningen som är lös mot en mjuk dubbelbindning och förena kolatomen och syreatomen med dubbelbindning.

5.   Tag HSCoA och sätt dess väte (med bindning) istället för den mjuka bindningen i kolatom två. Nu bildas en acetyl-CoA, lägg den för sig. Byt ut den mjuka bindningen som sitter lös mot en hård och sätt dit den lilla gröne som motsvarar –SCoA.

6.   Börja om från 2.